הסינוסים המצחיים הינם האתגר הגדול למנתח סינוסים אינדוסקופי. הסינוסים המצחיים ממוקמים במוח מעל העיניים ולכן הגישה אליהם דרך הנחיריים מצריכה כלים ייעודיים עם זווית מיוחדת, כולל מצלמות עם זווית, מה שמקשה על התמרון של המנתח להגיע אל האזור הדורש טיפול. הסינוסים עצמם הינם סינוסים גדולים אבל הפתח שלהם מאוד צר, עם תעלה ארוכה שעלולה להיפגע או להצטלק במהלך הניתוח, מה שגורם לחסימה של הסינוס והרעת מצב המטופל. לכן הניתוחים של הסינוסים המצחיים מצריכים הבנה וידע עמוק של אנטומית אזור הניתוח. חלק חשוב מאוד ומחייב בהערכה לקראת ניתוח של הסינוסים המצחיים, היא הדמיה של הסינוסים ובפרט c.t. המנתח נדרש להבנה ויכולת פיענוח גבוהה של ההדמיה והצילומים, מה שייתן למנתח את היכולת ליצור הבנה תלת ממדית של מיקום התעלה שמנקזת את הסינוסים המצחיים. ישנם הרבה וריאנטים אנטומיים שגורמים לקושי בזיהוי הניקוז של הסינוס המצחי, והגישה אליו מצריכה כירורגיה קרובה לארובת העין, והתמודדות עם כלי דם שמגיעים מארובת העין והמוח מלמעלה. כל אלו יחד גורמים לניתוח הסינוס המצחי להיחשב כניתוח המורכב ביותר מבין שאר הניתוחים האנדוסקופיים של הסינוסים.
