ציסטות הן תהליכים שכיחים בסינוסים שנוצרים כתוצאה מכליאת נוזל בתוך רירית, בדרך כלל מדובר בתהליכים קטנים חסרי משמעות קלינית. לעיתים נדירות הציסטות גדולות – חוסמות את הסינוס, ולעיתים אף פורצות את הסינוס לחלל האף. במצבים אלו הציסטות יכולות לגרום לתסמינים שהשכיחים בהם כאבים, חסימה אפית ובמקרים נדירים כשהן מתבקעות, להפרשה קצרה של נוזל כמו ברז. במצבים אלו מומלץ טיפול כירורגי להסרת הציסטה. בדרך כלל הרירית של הסינוסים תקינה, והסרה שלמה של הציסטה תהיה מספקת, ואין חובה להתייחס בניתוח לפתח הניקוז של הסינוס. בסינוסים הספנואידאלים והאיטמואידים חשוב לטפל בציסטות, מאחר שהתרחבותן יכולה לגרום ללחץ על עצבי הראיה. חשוב שוב להדגיש, שבמרבית הציסטות, אין צורך לטפל, והן מתגלות בממצא אקראי בהדמיה.
