בילדים מחלות בסינוסים פחות שכיחות. הסינוסים בילדים פחות גדולים ואינם מפותחים עד הסוף, ולכן הבעיות בהם פחות שכיחות. עם זאת בילדים קיימת נטייה יחסית לסיבוכים של סינוסיטיס. הסיבוכים כוללים מורסות / זיהום בארובות העיניים, במעטפת המוח, בעצם המצחית ובמוח עצמו. רוב הסיבוכים קשורים בדלקת שנובעת בסינוס המצחי והסינוסים האטמואידאלים. במצבים אלו מתחייב לתת טיפול אנטיביוטי דרך הווריד, ולעיתים לא רחוקות יחייבו כירורגיה לפתיחת הסינוסים המעורבים וניקוז המורסה / זיהום. כאשר הסינוס החולה הוא מצחי לפעמים נדרש לבצע ניקוז חיצוני דרך חתך בגבה.
